Xét nghiệm FT3 thường được bác sĩ chỉ định khi người bệnh có biểu hiện các triệu chứng của các bệnh lý tuyến giáp bao gồm cả cường giáp và suy giáp nhưng nồng độ FT4 bình thường hoặc ở gần giới hạn cao. FT3 cũng được chỉ định cùng với T3, FT4, TSH để chẩn đoán nguyên nhân suy giáp tại tuyến giáp hay tại tuyến yên.
Sử dụng FT3 để theo dõi hiệu quả điều trị đối với những người mắc bệnh cường giáp.